MT時代のfeedのURLをWPに合わせて置き換えるように.htaccessに設定してみました。
RewriteEngine On
RewriteBase /blog/
RewriteRule atom\.xml$ /blog/feed/atom [R,L]
RewriteRule rss\.xml$ /blog/feed/rss [R,L]
RewriteRule index\.xml$ /blog/feed [R,L]
RewriteRule index\.rdf$ /blog/feed [R,L]
MTからの乗り換え派が多いので、こういう情報はたくさん見つかりますね。